Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms