Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAP1L3Q99457 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms