Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCNX1Q96RV3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCNX1Q96RV3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCNX1Q96RV3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCNX1Q96RV3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCNX1Q96RV3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCNX1Q96RV3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCNX1Q96RV3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCNX1Q96RV3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PCNX1Q96RV3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCNX1Q96RV3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PCNX1Q96RV3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCNX1Q96RV3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCNX1Q96RV3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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