Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms