Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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