Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms