Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLMNQ96JQ2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms