Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms