Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD2Q96C19 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms