Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms