Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHMTQ93088 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms