Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3CQ92520 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3CQ92520 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms