Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms