Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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