Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms