Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms