Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms