Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms