Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms