Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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COL24A1Q17RW2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL24A1Q17RW2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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