Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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