Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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ZNF239Q16600 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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