Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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