Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms