Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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