Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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