Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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IRF4Q15306 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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IRF4Q15306 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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