Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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