Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
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