Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms