Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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