Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCOF1Q13428 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
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