Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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