Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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