Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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