Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms