Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms