Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NFX1Q12986 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms