Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms