Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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