Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms