Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms