Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms