Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms