Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP27A1Q02318 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 328.4 ms