Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDR2Q01850 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms