Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms