Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC01547P58512 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms