Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA9P57773 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms