Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PGGT1BP53609 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PGGT1BP53609 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PGGT1BP53609 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PGGT1BP53609 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PGGT1BP53609 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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PGGT1BP53609 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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